More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0046 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  68.03 
 
 
259 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  67.34 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  68.16 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  65.06 
 
 
258 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  66.67 
 
 
262 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  62.25 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  59.7 
 
 
271 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  59.33 
 
 
271 aa  308  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  63.12 
 
 
265 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  67.34 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  63.45 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  64.8 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  61.85 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  64.4 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  64.4 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  63.45 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  63.45 
 
 
265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  63.2 
 
 
263 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  62.25 
 
 
265 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  56.2 
 
 
279 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  56.85 
 
 
262 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  56.45 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  58.54 
 
 
264 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  56.05 
 
 
262 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  55.65 
 
 
255 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 
261 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  55.65 
 
 
264 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.69 
 
 
263 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  53.23 
 
 
255 aa  269  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  52.02 
 
 
255 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  52.02 
 
 
255 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  54.39 
 
 
255 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
255 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  53.97 
 
 
255 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  55.65 
 
 
262 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
255 aa  261  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.08 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  53.97 
 
 
255 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  53.56 
 
 
255 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  57.02 
 
 
262 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 
263 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  50.4 
 
 
268 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  50 
 
 
278 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  52.56 
 
 
264 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.39 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  53.55 
 
 
255 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.94 
 
 
261 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  52.47 
 
 
267 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
278 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
264 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.18 
 
 
256 aa  221  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.24 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  55.39 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  48.05 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.2 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.2 
 
 
262 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.43 
 
 
254 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.31 
 
 
260 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  53.15 
 
 
293 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  54.9 
 
 
253 aa  218  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  53.92 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.49 
 
 
258 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.15 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  53.15 
 
 
293 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.43 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  43.32 
 
 
273 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.55 
 
 
254 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.49 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 
260 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.7 
 
 
271 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.64 
 
 
274 aa  214  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 
259 aa  214  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.87 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  51.2 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.04 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  43.37 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.44 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.77 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.76 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  54.05 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.58 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.22 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.09 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  52.61 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  49.07 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>