More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1217 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
297 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
278 aa  217  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
276 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
297 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
294 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 
292 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
311 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
298 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.45 
 
 
302 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  39.62 
 
 
297 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
281 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  37.16 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
279 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  38.55 
 
 
283 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.29 
 
 
273 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
296 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  36.1 
 
 
304 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
261 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
298 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  40.37 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
298 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
297 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
270 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
270 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
284 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  38.55 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
298 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 
278 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
281 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
270 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.64 
 
 
299 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
275 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
274 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 
290 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  36.19 
 
 
288 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
277 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  38.77 
 
 
277 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
277 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
246 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  37.5 
 
 
278 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
269 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
278 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
278 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834032  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 
295 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
296 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.392482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
272 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
281 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  34.19 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
271 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
299 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
390 aa  162  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  35.19 
 
 
269 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.06 
 
 
304 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
285 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
268 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 
276 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
298 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  39.1 
 
 
273 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
280 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.89 
 
 
297 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
302 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  29.32 
 
 
275 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
271 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
286 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
294 aa  158  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.5 
 
 
319 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
290 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
271 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4881  monosaccharide-transporting ATPase  36.57 
 
 
269 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196924  normal  0.0342078 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
297 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
287 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
304 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
299 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.97 
 
 
277 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  31.91 
 
 
276 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
275 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
280 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
272 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  36.06 
 
 
272 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
295 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
280 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
278 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
277 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
306 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>