More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12849 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.91 
 
 
277 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  48.11 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
300 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.53 
 
 
301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 
307 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.59 
 
 
304 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
303 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
299 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.86 
 
 
284 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
299 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.07 
 
 
304 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
296 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
297 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
270 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  37.25 
 
 
315 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
273 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  34.73 
 
 
273 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
273 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  34.73 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  34.73 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  34.35 
 
 
273 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  34.35 
 
 
273 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
271 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
290 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  37.4 
 
 
281 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
286 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
281 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
277 aa  168  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
276 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
311 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
300 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 
296 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
298 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110391  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2016  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  34.85 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0189923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
291 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  33.71 
 
 
277 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
282 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.2 
 
 
272 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00114182  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3019  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.83 
 
 
281 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
315 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
282 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2095  sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter, binding protein inner membrane component  37.74 
 
 
282 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
278 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
282 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
301 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
295 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
275 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
275 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
282 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
349 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.83 
 
 
281 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
290 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2742  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3724  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
349 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.470539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3730  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
290 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3211  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.198924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1762  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3753  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2792  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
268 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
272 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
283 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  32.97 
 
 
306 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3695  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.08 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06398  ABC-type sugar transport system permease  35.78 
 
 
282 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
302 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3757  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.84 
 
 
281 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
278 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3824  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.84 
 
 
281 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4765  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.46 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.46 
 
 
281 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0265  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.46 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3872  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.46 
 
 
281 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
406 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3926  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.84 
 
 
281 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3867  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.84 
 
 
281 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3648  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.46 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3929  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.46 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3746  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  32.84 
 
 
281 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03300  glycerol-3-phosphate transporter subunit  32.46 
 
 
281 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03253  hypothetical protein  32.46 
 
 
281 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0376  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.83 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1266  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  35.42 
 
 
282 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75502  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
276 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>