More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2053 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  92.2 
 
 
282 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.46 
 
 
282 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110391  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.11 
 
 
282 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1266  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  85.11 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1285  twin-arginine translocation pathway signal  70.88 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.49 
 
 
282 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96596  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.07 
 
 
283 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0857223  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.61 
 
 
282 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.61 
 
 
282 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.14 
 
 
282 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.85 
 
 
283 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.18 
 
 
283 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2742  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3724  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3019  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.83 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2710  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.83 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0397  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.83 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3211  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.198924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1762  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3695  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.89 
 
 
281 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3753  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2792  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.08 
 
 
282 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.70012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.77 
 
 
281 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0376  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.48 
 
 
281 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.77 
 
 
281 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.12 
 
 
281 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  65.6 
 
 
281 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0236  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.48 
 
 
281 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3653  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.41 
 
 
281 aa  371  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.703589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0258  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.41 
 
 
281 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3960  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.41 
 
 
281 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.53735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.37 
 
 
282 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2016  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  63.48 
 
 
284 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0189923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0113  putative sugar ABC transporter (permease protein)  64.31 
 
 
282 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.31 
 
 
282 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.174842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.66 
 
 
282 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.54 
 
 
282 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17735  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3730  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3648  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  362  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0265  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  362  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4765  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  362  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3872  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  362  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03300  glycerol-3-phosphate transporter subunit  61.35 
 
 
281 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03253  hypothetical protein  61.35 
 
 
281 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3929  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  361  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.99 
 
 
281 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3854  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.06 
 
 
281 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3494  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.77 
 
 
281 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.38 
 
 
283 aa  358  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.936696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.12 
 
 
280 aa  358  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.83 
 
 
280 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3867  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3757  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3824  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3926  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3746  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0119  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.48 
 
 
281 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0127  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.12 
 
 
281 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3511  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.77 
 
 
281 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450535  normal  0.0797424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0446  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  62.41 
 
 
281 aa  351  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152206  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0619  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  64.31 
 
 
282 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4043  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.42 
 
 
282 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.25 
 
 
283 aa  333  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0657  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  63.96 
 
 
282 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3859  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.95 
 
 
282 aa  331  9e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.6 
 
 
282 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.606554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
282 aa  328  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209933 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3288  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpE  60.07 
 
 
287 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
287 aa  316  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340466  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3283  hypothetical protein  59.34 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06398  ABC-type sugar transport system permease  55.44 
 
 
282 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.26 
 
 
278 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 
306 aa  305  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.38 
 
 
281 aa  304  8.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12847  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.56 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.493685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2095  sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter, binding protein inner membrane component  55.21 
 
 
282 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0347  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  54.77 
 
 
283 aa  291  7e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1694  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  285  7e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1695  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1157  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  50.37 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0357  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  49.63 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5505  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  43.38 
 
 
295 aa  264  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
304 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
305 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059569  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0662  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 
297 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4504  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.59 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.369097  normal  0.590311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
305 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
291 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0439942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
279 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
276 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
279 aa  188  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
277 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.930102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
291 aa  175  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.86109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
273 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>