More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2050 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
282 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.2 
 
 
282 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.17 
 
 
282 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110391  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.46 
 
 
282 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1266  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  86.17 
 
 
282 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1285  twin-arginine translocation pathway signal  71.23 
 
 
283 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.2 
 
 
282 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96596  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.31 
 
 
283 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0857223  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.14 
 
 
282 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.14 
 
 
282 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.2 
 
 
283 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2742  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  66.31 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3724  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.08 
 
 
282 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2710  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0397  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3211  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.198924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1762  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3695  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3753  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2792  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0236  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.54 
 
 
281 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3653  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.12 
 
 
281 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.703589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3019  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.48 
 
 
281 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.48 
 
 
281 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.47 
 
 
283 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0376  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0258  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.12 
 
 
281 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.08 
 
 
282 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3960  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.12 
 
 
281 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.53735  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.66 
 
 
282 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.70012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0113  putative sugar ABC transporter (permease protein)  66.43 
 
 
282 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.08 
 
 
282 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.174842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.08 
 
 
282 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3730  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.7 
 
 
281 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03300  glycerol-3-phosphate transporter subunit  61.35 
 
 
281 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.99 
 
 
281 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2016  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  63.83 
 
 
284 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0189923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4765  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3929  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03253  hypothetical protein  61.35 
 
 
281 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.54 
 
 
282 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17735  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0265  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3872  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3648  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.08 
 
 
283 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.936696  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3867  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3824  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3757  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3926  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3746  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.35 
 
 
281 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3854  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.99 
 
 
281 aa  359  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0119  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.48 
 
 
281 aa  358  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3494  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.48 
 
 
281 aa  357  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.41 
 
 
280 aa  357  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0127  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.12 
 
 
281 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3511  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  64.18 
 
 
281 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450535  normal  0.0797424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0446  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  63.83 
 
 
281 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.77 
 
 
280 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4043  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.07 
 
 
282 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3859  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.6 
 
 
282 aa  332  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.93 
 
 
283 aa  331  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0619  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  62.19 
 
 
282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.56 
 
 
282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209933 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0657  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  61.84 
 
 
282 aa  323  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.84 
 
 
282 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.606554  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 
287 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340466  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.49 
 
 
282 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3288  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpE  59.49 
 
 
287 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06398  ABC-type sugar transport system permease  55.28 
 
 
282 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3283  hypothetical protein  58.76 
 
 
282 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.54 
 
 
278 aa  308  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2095  sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter, binding protein inner membrane component  56.94 
 
 
282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.8 
 
 
281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12847  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.2 
 
 
306 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.493685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.88 
 
 
306 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0347  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  55.48 
 
 
283 aa  295  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1694  hypothetical protein  51.31 
 
 
275 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1695  hypothetical protein  50.94 
 
 
275 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1157  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 
280 aa  279  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0357  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  52.12 
 
 
280 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 
304 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
304 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5505  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  43.05 
 
 
295 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059569  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0662  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
297 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4504  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.59 
 
 
297 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.369097  normal  0.590311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
305 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
291 aa  198  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0439942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
279 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
279 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
276 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
277 aa  182  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
288 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.930102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
291 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.86109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>