More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0453 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
154 aa  320  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  66.01 
 
 
152 aa  210  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  64.05 
 
 
152 aa  210  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  62.75 
 
 
168 aa  207  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  59.48 
 
 
162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  58.82 
 
 
153 aa  188  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.13 
 
 
157 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.78 
 
 
157 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  54.55 
 
 
164 aa  180  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  57.05 
 
 
164 aa  179  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  51.92 
 
 
162 aa  176  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.39 
 
 
160 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.6 
 
 
155 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.05 
 
 
158 aa  174  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.94 
 
 
156 aa  173  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.36 
 
 
157 aa  173  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  51.92 
 
 
162 aa  173  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.39 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.05 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  53.69 
 
 
156 aa  168  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.25 
 
 
154 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  51.63 
 
 
152 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.7 
 
 
158 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.98 
 
 
164 aa  165  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.6 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.29 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  50.97 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  50.97 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  49.02 
 
 
153 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.71 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  49.02 
 
 
153 aa  159  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.7 
 
 
153 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  50.97 
 
 
156 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  48.7 
 
 
169 aa  157  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  48.05 
 
 
182 aa  157  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46 
 
 
153 aa  153  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.63 
 
 
156 aa  153  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  49.36 
 
 
209 aa  150  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  51.32 
 
 
159 aa  149  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  48.39 
 
 
169 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  50 
 
 
162 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  50 
 
 
162 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  50 
 
 
162 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  48.39 
 
 
154 aa  146  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44 
 
 
152 aa  143  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.33 
 
 
154 aa  142  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.44 
 
 
157 aa  140  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.37 
 
 
171 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 
157 aa  140  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.37 
 
 
171 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  46.36 
 
 
154 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 
157 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  47.44 
 
 
157 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 
157 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  47.44 
 
 
157 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.37 
 
 
159 aa  140  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 
157 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.72 
 
 
157 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.79 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0044  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.94 
 
 
220 aa  139  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  47.83 
 
 
177 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.3 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.79 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.16 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.15 
 
 
157 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  43.59 
 
 
169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.37 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  45.45 
 
 
154 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  45.45 
 
 
154 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  45.45 
 
 
154 aa  137  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  46.1 
 
 
154 aa  137  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  44.81 
 
 
154 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.68 
 
 
155 aa  137  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
153 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  46.36 
 
 
153 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0359  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.81 
 
 
174 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012351  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.05 
 
 
151 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.32 
 
 
152 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  45.45 
 
 
154 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.41 
 
 
154 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.52 
 
 
154 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.29 
 
 
153 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  46.79 
 
 
170 aa  135  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.32 
 
 
152 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>