More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2422 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 216 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  94.33 
 
 		 216 aa  370  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  87.5 
 
 		 216 aa  340  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  82.9 
 
 		 213 aa  328  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  53.12 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.36 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  41.1 
 
 		 262 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 268 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  36.28 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.24 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  44.19 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.04 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  42.11 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  37 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.54 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.98 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  43.4 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.33 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  39.58 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.84 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  38.75 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.43 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.62 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.05 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  29.45 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 273 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  34.55 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  32.35 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.11 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.31 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.78 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.39 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>