108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3226 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  93.83 
 
 		 490 aa  814    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  97.33 
 
 		 486 aa  910    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  100 
 
 		 486 aa  947    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  69.92 
 
 		 493 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  48.86 
 
 		 493 aa  468  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  51.73 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  49.79 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  36.91 
 
 		 843 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.85 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.9 
 
 		 455 aa  267  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  38.15 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  38.03 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.37 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  38.46 
 
 		 495 aa  257  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.68 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.62 
 
 		 456 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.96 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  36.4 
 
 		 459 aa  251  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.45 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  38 
 
 		 469 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.07 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  27.72 
 
 		 453 aa  239  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  32.99 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  35.97 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.48 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.17 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.08 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.02 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.48 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.33 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.04 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.11 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.63 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  34.78 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.97 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.84 
 
 		 494 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  42.12 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  32.04 
 
 		 506 aa  199  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  33.4 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  33.4 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  30.2 
 
 		 511 aa  172  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  31.44 
 
 		 495 aa  87  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  33.18 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.71 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.73 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.76 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.27 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  25.25 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.08 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.59 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.65 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.69 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.85 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.85 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.65 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.75 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.75 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.34 
 
 		 501 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.14 
 
 		 476 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2125  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.27 
 
 		 479 aa  50.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.64 
 
 		 484 aa  50.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.15 
 
 		 483 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.27 
 
 		 491 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  26.7 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.31 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.57 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0813  hypothetical protein  24.14 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.94 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.53 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.97 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  29.02 
 
 		 271 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.45 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.07 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.92 
 
 		 480 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.98 
 
 		 425 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.46 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.8 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.34 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.16 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.14 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.77 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.36 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.29 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  26.32 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.2 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.17 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0636  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.42 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  26.32 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2800  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.42 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2376  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.42 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2911  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.22 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152719  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4333  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.26 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2734  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.42 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.913993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1691  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.42 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.82 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  26.04 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.99 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.76 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.03 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>