More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0081 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  811    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  59.8 
 
 
201 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  59.55 
 
 
181 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  58.99 
 
 
181 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  49.74 
 
 
201 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.54 
 
 
178 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  49.71 
 
 
173 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  42.05 
 
 
201 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  48.86 
 
 
183 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  48.07 
 
 
183 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.86 
 
 
183 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  48.3 
 
 
183 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  48.3 
 
 
183 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  44.63 
 
 
180 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.61 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  45.2 
 
 
178 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  46.02 
 
 
199 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  35.5 
 
 
202 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  42.86 
 
 
177 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  43.55 
 
 
207 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  42.39 
 
 
196 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  35.35 
 
 
203 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  43.48 
 
 
178 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.18 
 
 
181 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.18 
 
 
176 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
207 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  41.42 
 
 
177 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  34.95 
 
 
200 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  40.12 
 
 
178 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  39.88 
 
 
177 aa  126  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  39.89 
 
 
181 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.04 
 
 
186 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.57 
 
 
176 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  37.02 
 
 
177 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  37.85 
 
 
175 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
184 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  37.1 
 
 
184 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  33.7 
 
 
177 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
177 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.8 
 
 
177 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.05 
 
 
175 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  35.2 
 
 
180 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.81 
 
 
184 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  35.83 
 
 
183 aa  103  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  34.3 
 
 
180 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
182 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.02 
 
 
174 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  32.54 
 
 
199 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  34.36 
 
 
210 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
225 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 
200 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  34.46 
 
 
172 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  35.36 
 
 
173 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.77 
 
 
176 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.4 
 
 
175 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.56 
 
 
174 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
174 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  35.56 
 
 
173 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  35 
 
 
173 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  34.44 
 
 
173 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
199 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
224 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  89.7  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  34.81 
 
 
173 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  34.81 
 
 
173 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
210 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  34.44 
 
 
173 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
192 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  34.25 
 
 
173 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
215 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  27.46 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  30 
 
 
214 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
199 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.05 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  32.17 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.41 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30 
 
 
218 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 
251 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.17 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
211 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
187 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 
186 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.51 
 
 
182 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.59 
 
 
266 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  27.84 
 
 
198 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
180 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.96 
 
 
180 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>