More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2825 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  100 
 
 		 243 aa  497  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  56.1 
 
 		 215 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  56.59 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  54.68 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  54.68 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  54.68 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  54.68 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  54.68 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  54.68 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  54.68 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  50.7 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  52.66 
 
 		 210 aa  224  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  52.2 
 
 		 218 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  50.72 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  49.76 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  51.2 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  51.22 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  51.71 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  49.52 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  54.41 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  54.41 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  54.41 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  54.41 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  49.76 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  50.24 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  48.8 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  50.24 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  53.92 
 
 		 212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  51.66 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  48.34 
 
 		 220 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  51.66 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  50.98 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  52.88 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  49.28 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  48.6 
 
 		 211 aa  208  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  49.02 
 
 		 217 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  48.62 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  45.19 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  43.27 
 
 		 214 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  53.49 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  47.06 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  47.06 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  46.46 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  40.19 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  42.31 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  41.67 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  43.68 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  41.06 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  43.39 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  41.59 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  41.55 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  41.06 
 
 		 212 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  44.44 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  42.03 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  42.03 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  42.03 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  42.51 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  42.03 
 
 		 213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  41.55 
 
 		 213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  43.92 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  43.92 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  43.92 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  43.92 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  43.92 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  39.79 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  39.79 
 
 		 212 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  41.06 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  40.78 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  39.55 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  40.18 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  37.78 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  36.76 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  36.51 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.46 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  36.32 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.17 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  31.75 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  34.04 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  30.56 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  32.26 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  34.03 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.69 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  37.5 
 
 		 219 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  31.52 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  35 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  28.8 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  33.69 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  30.7 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 		 180 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 		 190 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  36.36 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  35.26 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 		 215 aa  95.9  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  31.22 
 
 		 197 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  34.78 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>