268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0312 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 137 aa  267  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 137 aa  267  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  79.85 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  78.36 
 
 		 137 aa  210  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  78.63 
 
 		 141 aa  210  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  76.87 
 
 		 136 aa  207  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  76.12 
 
 		 136 aa  206  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  76.34 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  74.63 
 
 		 137 aa  203  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  75.76 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  76.87 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  76.87 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  76.87 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  76.87 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  76.87 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  64.18 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  65.15 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  64.18 
 
 		 137 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  65.15 
 
 		 139 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  62.41 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  64.18 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  64.39 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  63.43 
 
 		 136 aa  176  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  63.43 
 
 		 136 aa  176  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  62.69 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  62.69 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  62.69 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  62.88 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  61.94 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  61.94 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  61.94 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  61.94 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  61.19 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  60.31 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  59.69 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  55.3 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  63.64 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  59.69 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  61.07 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  55.91 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  56.15 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  57.58 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  56.39 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  59.4 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  53.49 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  58.21 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  59.4 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  52.94 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1655  large conductance mechanosensitive channel protein  59.84 
 
 		 123 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  56.49 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  55.3 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  53.62 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  55.22 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  53.79 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  55.64 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  55.64 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  55.64 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  55.64 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  49.26 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  54.89 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  49.64 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  51.43 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  56.72 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  51.13 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  50.37 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  49.63 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  52.99 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  52.86 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  51.54 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  48.2 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  48.2 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  50.37 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  49.22 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  52.52 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  50.37 
 
 		 142 aa  120  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  54.81 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  51.47 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  46.53 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  47.14 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  50.74 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>