201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2341 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2341  porin  100 
 
 		 236 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  47.72 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  44.93 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  39.48 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  39.53 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  41.8 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  40.19 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  41.31 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  40.32 
 
 		 248 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  39.83 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  38.22 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  40.49 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  40.93 
 
 		 452 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  43.48 
 
 		 206 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  41.53 
 
 		 453 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  39.13 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  42.45 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  37.84 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  37.84 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  41.79 
 
 		 212 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  36.24 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  36.24 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  42.44 
 
 		 447 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  37.78 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  37.73 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  39.68 
 
 		 710 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  45.78 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  36.24 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  39.58 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  41.15 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  37.34 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  40.98 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  37 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  36.59 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  37.62 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  40.08 
 
 		 449 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  38.1 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  40.39 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  38.96 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  40.53 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  35.87 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  36.82 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  35.78 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  36.56 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  40.95 
 
 		 449 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  36.63 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  38.2 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  36.67 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  36.69 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  37.17 
 
 		 209 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  40.17 
 
 		 454 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  35.71 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  35.71 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.19 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  35.75 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  35.78 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  41.63 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  37.02 
 
 		 302 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  34.34 
 
 		 570 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  35.86 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  35.74 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  37.25 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  35.35 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  34.3 
 
 		 692 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  37.07 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  41.67 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  41.67 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  35.08 
 
 		 571 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  41.67 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  36.02 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  42.11 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  41.67 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  37.96 
 
 		 288 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  38.37 
 
 		 288 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  35.87 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  38.46 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  40.59 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  39.17 
 
 		 296 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  41.55 
 
 		 302 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.32 
 
 		 997 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  34.8 
 
 		 662 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  42.71 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  43.37 
 
 		 288 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  34.19 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  43.37 
 
 		 288 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  35.9 
 
 		 689 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  36.73 
 
 		 296 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  34.5 
 
 		 566 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  36.73 
 
 		 296 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  42.86 
 
 		 288 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  36.28 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  36.41 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  33.07 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  34.84 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  34.32 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  38.21 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  34.91 
 
 		 661 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  37.16 
 
 		 670 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  41.18 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  35.29 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>