290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1660 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  66.22 
 
 
297 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  66.11 
 
 
297 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  67.57 
 
 
297 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  61.49 
 
 
296 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  61.95 
 
 
298 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  63 
 
 
297 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  61.2 
 
 
296 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  59.6 
 
 
298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  60.14 
 
 
299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  60.14 
 
 
299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  58.92 
 
 
298 aa  322  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  58.59 
 
 
298 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  59.53 
 
 
296 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  59.8 
 
 
295 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  58.39 
 
 
296 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  62.63 
 
 
298 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  57.43 
 
 
299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  58.25 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  59.87 
 
 
295 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  71.3 
 
 
226 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  68.51 
 
 
241 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  57.58 
 
 
325 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  55.74 
 
 
296 aa  295  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  55.07 
 
 
291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  52.53 
 
 
291 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  57.82 
 
 
297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  52.88 
 
 
291 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
291 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  53.51 
 
 
292 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  57.63 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  57.38 
 
 
291 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  50.34 
 
 
291 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  56.78 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  53.95 
 
 
292 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.84 
 
 
299 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  44.48 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  46.94 
 
 
294 aa  195  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 
281 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  45.32 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  41.38 
 
 
297 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.83 
 
 
411 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.16 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  44.33 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  48.83 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.83 
 
 
279 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  47.76 
 
 
279 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  48.5 
 
 
237 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  40.86 
 
 
398 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  44.74 
 
 
435 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  48.26 
 
 
281 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  46.19 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 
241 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  45.64 
 
 
276 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  43.22 
 
 
404 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  46.57 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  46.27 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  47.6 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  44.66 
 
 
307 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  47.26 
 
 
281 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 
403 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 
400 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.83 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  42.86 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.83 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  37.96 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  46.27 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  45.85 
 
 
316 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  42.51 
 
 
419 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  44.76 
 
 
236 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  40.91 
 
 
326 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 
429 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  36.7 
 
 
327 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  40.91 
 
 
326 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 
285 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  40.91 
 
 
326 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  45.24 
 
 
235 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  39.66 
 
 
398 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 
310 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  40.36 
 
 
325 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  41.02 
 
 
420 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.13 
 
 
410 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  42.68 
 
 
419 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  43.6 
 
 
400 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 
454 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 
406 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  40.71 
 
 
325 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  43.7 
 
 
404 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  39.17 
 
 
325 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  44.6 
 
 
236 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>