224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0989 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  45.78 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  45.38 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  46.53 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  46.53 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  46.53 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  46.18 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  46.18 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  45.78 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  46.96 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  45.58 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  45.58 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  45.58 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  45.58 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  45.58 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  44.26 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  45.58 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  45.58 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  45.85 
 
 		 243 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  45.85 
 
 		 243 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  41.3 
 
 		 274 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  44.84 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 276 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  43.04 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  41.67 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  39.49 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  39.57 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  39.49 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  39.49 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  39.49 
 
 		 274 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  39.49 
 
 		 274 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  43.69 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  43.69 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  42.31 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  39.13 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  41.04 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  40.22 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  38.99 
 
 		 277 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  39.22 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  39.61 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  39.22 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  38.82 
 
 		 277 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  38.27 
 
 		 277 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  38.27 
 
 		 277 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  38.04 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  37.41 
 
 		 286 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  36.96 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  36.08 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  38.37 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  35.63 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  35.39 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  35.54 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  31.87 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  32.94 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  33.73 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  34.25 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  30.74 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  29.92 
 
 		 204 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  28.96 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  28.35 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  29.67 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  29.8 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  28.81 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  29.29 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  30 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.99 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.99 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  30.2 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  26.94 
 
 		 464 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  26.94 
 
 		 464 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  26.94 
 
 		 464 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  29.22 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  30.58 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  32.14 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  26.03 
 
 		 382 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  27.46 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  29.92 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  29.09 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  25.85 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  30.29 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  30.29 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  25.46 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  29.22 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  29.83 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  29.05 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  25.46 
 
 		 498 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>