106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0552 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  100 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  44.76 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  48.72 
 
 		 197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  43.79 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  40.69 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  40.15 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  44.44 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  41.32 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  37.01 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 166 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  47.62 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  39.26 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  47.62 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  42.74 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  40.32 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  36.29 
 
 		 151 aa  97.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  34.73 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  36.43 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  38.75 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  94.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  40.62 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  38.89 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  42.72 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  30.2 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  38.13 
 
 		 168 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  39.29 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  36.52 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  36.52 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  36.52 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  36.52 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  34.78 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  41 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  29.58 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  33.11 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  35.04 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  35.09 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  35.77 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  34.06 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  35.04 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  34.53 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  39.45 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  39.45 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  39.45 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  39.45 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  36.43 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  37.31 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  37.31 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  31.9 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  37.37 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  35.1 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  32.82 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  30.83 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  24.31 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  35.05 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  30.66 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  35.05 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  31.78 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  29.13 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  22.31 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.48 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  39.74 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  39.74 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  39.74 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  32.99 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2179  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000218689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  34.26 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  31.78 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  32.99 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  22.95 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  28.47 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  23.2 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  23.2 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  24.4 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.41 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  27.82 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  35.66 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  22.76 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.41 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>