More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0440 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 421 aa  868    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  74.76 
 
 		 420 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  81.6 
 
 		 418 aa  723    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  76.39 
 
 		 419 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  83.05 
 
 		 420 aa  723    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  69.71 
 
 		 421 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  70.84 
 
 		 419 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  67.7 
 
 		 420 aa  586  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  66.02 
 
 		 419 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  63.92 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  63.92 
 
 		 414 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  63.9 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  64.15 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  56.97 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  53.73 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  57.92 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  58.23 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  56.26 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  56.03 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  54.96 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  54.22 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  49.63 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  47.76 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  50.62 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  45.81 
 
 		 415 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  45.28 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  44.95 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  45.5 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  47.23 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  44.11 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  43.28 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  40.2 
 
 		 414 aa  293  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  39.45 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  37.13 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  37.63 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  36.88 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  37.99 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  36.32 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  39.46 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  39.07 
 
 		 404 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  37.28 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  37.53 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  37.89 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  37.59 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  33.18 
 
 		 460 aa  206  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  36.08 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  32.69 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  32.4 
 
 		 388 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30.24 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.04 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.12 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.4 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  32.53 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  32.08 
 
 		 341 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  33.19 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  31.43 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.91 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.63 
 
 		 341 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  34.27 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  30.68 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.67 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  30.8 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  31.53 
 
 		 359 aa  97.4  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  30.6 
 
 		 341 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  29.46 
 
 		 344 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  30.03 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.22 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.14 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  31.34 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 340 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  29.34 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  31.87 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  29.44 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  29.44 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  30.42 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  30.36 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  29.34 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  31 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  31.49 
 
 		 363 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  30.37 
 
 		 343 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  28.89 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  28.47 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  29.93 
 
 		 356 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  29.28 
 
 		 319 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  30.08 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  27.64 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  27.41 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  29.31 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  28.34 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>