249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0796 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  59.16 
 
 		 204 aa  233  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  59.16 
 
 		 204 aa  230  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  58.73 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  39.73 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  41.48 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  41.27 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  31.77 
 
 		 220 aa  98.6  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  35.51 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  32.18 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.64 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  36.21 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1221  SCO1/SenC family protein  30.85 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  32.85 
 
 		 297 aa  94.7  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 210 aa  94.4  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 215 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  35.07 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  35.07 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 210 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  29.78 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1138  conserved hypothetical protein, probable SCO1/SenC family protein  33.69 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  36.51 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  32.06 
 
 		 287 aa  90.9  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  38.6 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  38.6 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  31.34 
 
 		 286 aa  89.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  35.54 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.83 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  34.93 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  35.65 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  35.65 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 204 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 217 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 275 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  33.77 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.13 
 
 		 226 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 219 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0903  SCO1/SenC family protein  29.19 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000309759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 219 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  34.32 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 226 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  33.58 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.63 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35.04 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  36.75 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 231 aa  84.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>