More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04961 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  74.05 
 
 
281 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3587  flagellin domain-containing protein  49.13 
 
 
345 aa  292  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3589  flagellin domain-containing protein  48.82 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  53.16 
 
 
299 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  51.92 
 
 
267 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  51.04 
 
 
272 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  51.92 
 
 
267 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3639  flagellin-like protein  51.92 
 
 
266 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  50.87 
 
 
268 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
270 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3959  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  50.35 
 
 
264 aa  245  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  47.68 
 
 
303 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  47.4 
 
 
276 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  50 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  48.96 
 
 
272 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  48.28 
 
 
273 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  46.6 
 
 
272 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  48.96 
 
 
271 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  48.96 
 
 
271 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  46.6 
 
 
272 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  46.03 
 
 
296 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  47.08 
 
 
271 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  47.08 
 
 
271 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  49.31 
 
 
272 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  47.77 
 
 
272 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  48.61 
 
 
273 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  48.3 
 
 
273 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  47.77 
 
 
273 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  48.96 
 
 
272 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  47.4 
 
 
271 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  47.4 
 
 
271 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  48.96 
 
 
273 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0199  flagellin  46.13 
 
 
296 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  47.59 
 
 
272 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  46.88 
 
 
280 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  47.93 
 
 
273 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  48.61 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  59.9 
 
 
392 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  47.92 
 
 
272 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
271 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  45.58 
 
 
275 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  45.58 
 
 
275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  45.49 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  45.14 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  44.82 
 
 
294 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  44.44 
 
 
270 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  43.49 
 
 
271 aa  208  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  43.15 
 
 
271 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  43.15 
 
 
271 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  35.84 
 
 
379 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  44.86 
 
 
277 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  42.41 
 
 
283 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  43.25 
 
 
276 aa  205  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  45.36 
 
 
283 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  42.21 
 
 
273 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  43.1 
 
 
274 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  40.85 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  41.52 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  43.6 
 
 
274 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  43.64 
 
 
314 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  40.13 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  34.38 
 
 
376 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  41.4 
 
 
278 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  36.48 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  44.86 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  42.28 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  35.13 
 
 
384 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  41.02 
 
 
271 aa  195  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  43.64 
 
 
282 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  42.47 
 
 
276 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  41.02 
 
 
271 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  42.39 
 
 
304 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  42.39 
 
 
304 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  42.51 
 
 
287 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  45.7 
 
 
283 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  42.27 
 
 
272 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  41.02 
 
 
271 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  41.02 
 
 
271 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  42.21 
 
 
276 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  40.13 
 
 
290 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  41.86 
 
 
295 aa  191  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  44.26 
 
 
288 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  42.57 
 
 
295 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  45.21 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  38.91 
 
 
274 aa  188  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  39.53 
 
 
286 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  40.54 
 
 
287 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  39.94 
 
 
304 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  40.83 
 
 
271 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  41.1 
 
 
262 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  39.81 
 
 
319 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  40.34 
 
 
278 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  41.79 
 
 
281 aa  185  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  40.6 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  42.59 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  37.72 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>