More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02485 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  90.53 
 
 
475 aa  844  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  955  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  42.42 
 
 
467 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  42.42 
 
 
467 aa  346  7e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  40.9 
 
 
474 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  40.9 
 
 
474 aa  335  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  39.1 
 
 
464 aa  312  9e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  39.1 
 
 
464 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  38.17 
 
 
473 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  38.4 
 
 
470 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  38.4 
 
 
476 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  38.17 
 
 
473 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  34.33 
 
 
466 aa  269  7e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 
474 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  35.43 
 
 
469 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  31.56 
 
 
473 aa  249  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 
494 aa  244  2e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  30.45 
 
 
480 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56631e-10 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 
508 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 
490 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  31.44 
 
 
445 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  31.44 
 
 
445 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  30.11 
 
 
472 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 
499 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  27.27 
 
 
473 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  27.27 
 
 
473 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  27.27 
 
 
473 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  27.27 
 
 
473 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  29.57 
 
 
472 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  27.27 
 
 
473 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  31.06 
 
 
503 aa  199  9e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  29.26 
 
 
495 aa  199  1e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.18 
 
 
511 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  28.7 
 
 
511 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.7 
 
 
511 aa  193  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.7 
 
 
511 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.7 
 
 
511 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.7 
 
 
511 aa  193  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  28.7 
 
 
511 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.7 
 
 
511 aa  193  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.7 
 
 
511 aa  193  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  31.67 
 
 
511 aa  192  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
495 aa  191  3e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.14 
 
 
485 aa  189  6e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  28.92 
 
 
485 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  27.33 
 
 
506 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  27.93 
 
 
506 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
720 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.7 
 
 
472 aa  132  1e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 
464 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  24.14 
 
 
494 aa  123  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 
455 aa  113  8e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 
481 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 
500 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  23.27 
 
 
467 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  23.19 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.67074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  24.94 
 
 
495 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 
504 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 
504 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 
504 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.71 
 
 
495 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 
500 aa  93.2  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  1.96904e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.13 
 
 
489 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 
503 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 
502 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  24.07 
 
 
476 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  24.06 
 
 
465 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 
497 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
460 aa  82.4  2e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  25.06 
 
 
498 aa  81.6  3e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.61 
 
 
471 aa  79.7  1e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.61 
 
 
471 aa  79.7  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 
515 aa  79.7  1e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.61 
 
 
471 aa  79.7  1e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09071e-05 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.61 
 
 
471 aa  79.7  1e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.61 
 
 
471 aa  79.7  1e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  24.38 
 
 
498 aa  79.3  1e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 
468 aa  79.7  1e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  27.32 
 
 
479 aa  79.7  1e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  22.83 
 
 
446 aa  79  2e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.46 
 
 
471 aa  78.6  2e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.46 
 
 
471 aa  78.6  2e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.46 
 
 
471 aa  78.6  2e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.43 
 
 
471 aa  78.6  2e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  24.86 
 
 
479 aa  78.2  3e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.12 
 
 
471 aa  77.8  4e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  24.02 
 
 
473 aa  77.4  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  24.02 
 
 
473 aa  77.4  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  24.02 
 
 
473 aa  77.4  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  24.02 
 
 
473 aa  77.4  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  24.02 
 
 
473 aa  77  6e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  24.63 
 
 
426 aa  76.6  8e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  24.5 
 
 
782 aa  75.9  1e-12  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  24.18 
 
 
470 aa  76.3  1e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  25.84 
 
 
479 aa  76.3  1e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 
471 aa  75.5  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 
520 aa  75.9  2e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2046  amino acid permease family protein  23.43 
 
 
496 aa  74.7  3e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2332  amino acid permease family protein  23.74 
 
 
496 aa  74.7  3e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  24.3 
 
 
476 aa  74.7  3e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>