More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001299 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  87.38 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  68.52 
 
 		 219 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  58.6 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  43.41 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.33 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  42.93 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.84 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  37.91 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 222 aa  134  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.2 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  36.49 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  36.54 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  36.54 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  36.54 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  36.54 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  36.54 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  36.54 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 271 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 728 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  35.55 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  36.54 
 
 		 762 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  33.98 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.58 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  36.06 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 714 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  37.21 
 
 		 707 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.8 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2477  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2343  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  36.28 
 
 		 710 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  36.28 
 
 		 707 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  39.01 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.7 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  34.6 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  36.71 
 
 		 229 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  35.29 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  32.55 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.56 
 
 		 223 aa  104  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.23 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.93 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.97 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.64 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  38.54 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.41 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  34.64 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.55 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  33.19 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  33.86 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1907  HAD superfamily hydrolase  30.17 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1217  HAD family sugar phosphatase  29.36 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.08 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  31 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.39 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.27 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.3 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  36.18 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.89 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  33.69 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  31.72 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  33.68 
 
 		 286 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  31.55 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  32.09 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  32.09 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  30.33 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 		 224 aa  91.3  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.16 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.95 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  32.86 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  31.51 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  37 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.33 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  31.53 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  31.37 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.16 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.33 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>