86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000936 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  67.14 
 
 		 304 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  65.28 
 
 		 288 aa  391  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  53.76 
 
 		 289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  50.19 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  38.26 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  41.96 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  41.26 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  37.72 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  37.54 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  40.14 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  39.93 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  39.47 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  39.1 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  39.19 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  37.81 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  40.38 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  38.29 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.21 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 		 307 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  37.27 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  39.1 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  39.03 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  38.38 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 		 486 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  37.93 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  37.45 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  37.45 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.37 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  35.21 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  31.72 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  30.86 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  28.2 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  20.88 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  23.89 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  23.89 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.26 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  21.15 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  22.04 
 
 		 444 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  22.77 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 441 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.29 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.29 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  22.55 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  20.08 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  22.57 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.01 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  20.83 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  22.12 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  23.27 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  21.76 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  20.42 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  22.57 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  22.57 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  22.57 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  23.01 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  22.57 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  21.13 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>