More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1129 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  49.46 
 
 
107 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  52.22 
 
 
108 aa  105  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  51.19 
 
 
106 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  50.54 
 
 
104 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  50.54 
 
 
104 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  51.14 
 
 
109 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  48.89 
 
 
109 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  46.24 
 
 
108 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  49.46 
 
 
104 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  48.35 
 
 
109 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  44.9 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  43.33 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  48.81 
 
 
110 aa  98.2  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  47.87 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  47.25 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.39 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  47.25 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  44.09 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.9 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.81 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  52.94 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  46.59 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  44.33 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  44.33 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  54.43 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  44.68 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  47.56 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  45.56 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  50.63 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  39.69 
 
 
136 aa  94.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  54.05 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.39 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  48.78 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  47.56 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  47.56 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  46.81 
 
 
107 aa  94  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  46.81 
 
 
107 aa  94  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47.62 
 
 
107 aa  94  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  46.34 
 
 
107 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  47.78 
 
 
107 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  47.56 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  49.37 
 
 
109 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  93.6  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  44.83 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  46.84 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  44.83 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  46.43 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  41.67 
 
 
106 aa  93.6  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  47.56 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  47.56 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  46.34 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  44.71 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  46.91 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  47.31 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  47.22 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  45.05 
 
 
238 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  54.93 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  52.11 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  52.11 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  37.31 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  43.62 
 
 
107 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  47.56 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  47.56 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  50 
 
 
141 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  45.12 
 
 
106 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  43.62 
 
 
107 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  42.71 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  38.79 
 
 
133 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.39 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  45.12 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  40.62 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.68 
 
 
148 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  43.33 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  49.28 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  43.48 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  54.79 
 
 
223 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  50.67 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  46.34 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  36.22 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  40.86 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  47.62 
 
 
105 aa  90.5  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  46.99 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  45.12 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  49.41 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.17 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  44.71 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  36.67 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>