268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0611 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  49.5 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  44.77 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  41.85 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  40.62 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  35.94 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  40.42 
 
 		 511 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  40.97 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.27 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  36.95 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  35.49 
 
 		 330 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  36.74 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  36.74 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  37.08 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  36.36 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  37.96 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  37.55 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.32 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  34.47 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.37 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  31.49 
 
 		 398 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  32.55 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  34.74 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  35.09 
 
 		 393 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.47 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.09 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  33.59 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.72 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  33.59 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.72 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.72 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.72 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  34.59 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  35.66 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.46 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  29.74 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  29.77 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.26 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 		 343 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  35.18 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  23.15 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.73 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  24.84 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  29.75 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  24.75 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  20.54 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  22.19 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  22.86 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.9 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  22.83 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  22.19 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  22.83 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  25.62 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  21.1 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  23.03 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  25.79 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  23.85 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  21 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  25.44 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.17 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  36.81 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  23.4 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.15 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  23.4 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  23.85 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  23.85 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  23.08 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  24.58 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  24.58 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.17 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  25.62 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  26.14 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  22.62 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  23.25 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  20.63 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>