74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1060 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
159 aa  322  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  62.12 
 
 
149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  54.41 
 
 
150 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  59.85 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  57.46 
 
 
162 aa  150  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  57.35 
 
 
146 aa  148  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  50.74 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  49.29 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  46.72 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  36.57 
 
 
148 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  41.3 
 
 
144 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  39.71 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  32.35 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  41.94 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  31.62 
 
 
139 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  29.85 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  34.53 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  35.21 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  30.43 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  34.04 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  34.04 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  35.25 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  27.41 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  30.83 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  29.23 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  34.51 
 
 
140 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  25.87 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  26.12 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  28.46 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  27.69 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  27.69 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  31.62 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  30.23 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  30.23 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  27.08 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  28.36 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  29.46 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  27.34 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  27.61 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  32.56 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  29.71 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  30.09 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  19.72 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  27.14 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  28.32 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  27.43 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  25.66 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  33.94 
 
 
126 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  21.62 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  27.5 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  23.21 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  32.28 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  21.93 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  29.92 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  29.92 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  29.92 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2441  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  26.09 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  20.18 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  24.47 
 
 
125 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  23.81 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  29.17 
 
 
163 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  21.9 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  29.92 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  27.05 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  30.28 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  17.78 
 
 
150 aa  40.4  0.01  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0063  hypothetical protein  30.53 
 
 
122 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>