60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2390 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  334  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  92.59 
 
 
162 aa  311  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  50.35 
 
 
150 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  54 
 
 
149 aa  153  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  57.46 
 
 
159 aa  150  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  51.88 
 
 
146 aa  147  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  47.79 
 
 
140 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  50.74 
 
 
134 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  41.89 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  43.06 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  41.61 
 
 
152 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  35.82 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  36.84 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  32.33 
 
 
148 aa  84.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  32.33 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  30.34 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  31.06 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  32.06 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  28.79 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  29.01 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  32.33 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  28.17 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  28.03 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  26.9 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  31.3 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  26.67 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  26.21 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  28.97 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  26.56 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  28.97 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  27.78 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  29.32 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  26.06 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  26.06 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  29.32 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  23.24 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  28.91 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  27.59 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  28.77 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  27.21 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  24.06 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  23.48 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  25.35 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  20 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  26.36 
 
 
141 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  25.45 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  25.3 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  25.32 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  28.69 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  23.01 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  23.01 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  26.36 
 
 
174 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  22.12 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>