60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2713 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  100 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  82.39 
 
 		 148 aa  249  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  81.69 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  81.69 
 
 		 148 aa  248  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  80.28 
 
 		 148 aa  247  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  75.69 
 
 		 148 aa  233  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  75.69 
 
 		 148 aa  233  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  75.69 
 
 		 148 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  75.69 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  61.87 
 
 		 167 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  50.71 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  49.3 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  46.1 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  46.97 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  44.03 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  47.33 
 
 		 139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  40.69 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  46.56 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  40.29 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  45.99 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  42.22 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  41.61 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  39.57 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  39.57 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  40.58 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  37.96 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  38.73 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  36.88 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  40.16 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  28.87 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  25.87 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  29.93 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  26.9 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  27.07 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  28.26 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  26.21 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  24.62 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  25.34 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  30.17 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  28.45 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  32.73 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  26.81 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  28.18 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  29.06 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  22.76 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  22.76 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  22.76 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  22.22 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  21.32 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  27.27 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000812  immunogenic protein  29.36 
 
 		 336 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>