53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0784 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  100 
 
 		 141 aa  291  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  97.87 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  62.32 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  59.71 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  58.82 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  59.71 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  58.27 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  52.9 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  29.05 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  31.86 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  27.43 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  28.8 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  26.79 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  28.15 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  27.12 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  26.55 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  29.08 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  26.36 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  26.89 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  26.32 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  28.21 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  27.87 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  25.86 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  27.83 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  28.45 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  27.83 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  25.86 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  27.19 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  27.83 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  26.96 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  26.96 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  25.86 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  26.96 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  27.2 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  26.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  22.12 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  29.51 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  28.7 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  22.41 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  24.58 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  26.05 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  24.63 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  24.79 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  23.93 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  23.24 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  27.12 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  27.59 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>