60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1070 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  74.29 
 
 		 140 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  68.57 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  68.57 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  60.71 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  61.43 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  60 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  60 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  48.87 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  48.51 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  45.99 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  48.2 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  48.2 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  47.37 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  46.76 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  44.03 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  46.76 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  44.2 
 
 		 167 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  46.72 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  45.99 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  46.72 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  44.88 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  41.13 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  41.04 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  46.67 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  45.86 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  39.86 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  43.8 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  34.01 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  37.86 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  35.82 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  41.94 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  37.96 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  35.61 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  28.67 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  35.46 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  29.58 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  31.47 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  31.36 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  27.48 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  28.81 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  27.97 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  26.27 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  28.21 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  28.21 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  25.86 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  27.2 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  24.3 
 
 		 132 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  26.4 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>