57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1167 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  98.65 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  91.89 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  80.41 
 
 		 148 aa  253  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  79.05 
 
 		 148 aa  249  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  77.7 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  79.73 
 
 		 148 aa  246  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  75.69 
 
 		 145 aa  233  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  63.31 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  52.52 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  48.63 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  50.38 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  48.2 
 
 		 140 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  47.33 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  45.71 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  45.8 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  43.57 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  48.09 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  43.94 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  46.56 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  40.88 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  45.8 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  41.79 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  42.34 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  39.44 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  40.29 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  40.29 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  37.41 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  35 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  32.85 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  33.58 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  30.66 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  34.06 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  30.6 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  30.23 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  28.97 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  28.97 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  27.54 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  27.82 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  27.94 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  27.13 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  32.74 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  28.15 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  24.44 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  27.83 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  26.83 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  26.83 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  26.83 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  27.83 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  28.32 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  28.32 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>