56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01435 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  41.89 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  34.69 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  33.56 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  33.79 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  30.28 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  33.81 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  30.23 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  31.03 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  28.67 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  33.78 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  30.28 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  27.59 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  31.25 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  28.67 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  30.34 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  29.66 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  30.34 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  31.03 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  26.24 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  31.03 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  30.34 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  29.66 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  28.12 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  28.97 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  27.4 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  26.71 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  25.34 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  19.72 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  21.28 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  23.91 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  21.9 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  20 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  18.62 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  21.53 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  19.18 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  28.15 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  29.51 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  31.15 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  27.83 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  28.69 
 
 		 143 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  22.58 
 
 		 134 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  25.44 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  29.51 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  23.02 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4269  hypothetical protein  24.27 
 
 		 128 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.237355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>