41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0949 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  310  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  67.13 
 
 		 148 aa  216  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  58.82 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  57.34 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  57.66 
 
 		 141 aa  189  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  58.74 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  57.34 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  56.64 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  28.26 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  29.91 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  25.66 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  28.95 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  25.93 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  24.49 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  25.32 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  29.06 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  20.98 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  30.7 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  29.03 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  26.45 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  25 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  28.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  25.64 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  24.35 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  26.09 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  25.42 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  27.97 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  24.11 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  23.39 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  25.44 
 
 		 144 aa  43.9  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  28.12 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  30.21 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  30.11 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  28.07 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  26.37 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>