45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6103 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  316  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  49.29 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  41.61 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  40.88 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  41.18 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  39.85 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  38.28 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  30.3 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  27.74 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  31.5 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  31.93 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  27.94 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  27.94 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  29.6 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  25.95 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  26.62 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  28.8 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  31.2 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  27.34 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  28 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  28.03 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  28.03 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  28.24 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  26.49 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  25.98 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  27.54 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  23.18 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  25.2 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  25.6 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  26.92 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  23.62 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  27.66 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  24.63 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  24.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  22.76 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  24.81 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  26.09 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>