45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0728 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  38.19 
 
 
148 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  35.88 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  39.71 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  34.33 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  36.17 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  30.53 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  37.04 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  36.09 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  32.61 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  28.77 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  31.09 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  28.75 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  27.91 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  25.66 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  27.01 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  26.36 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  26.36 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  24.81 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  24.81 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  23.53 
 
 
140 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  22.83 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  24.03 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  24.44 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  23.91 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  23.91 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  23.7 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  22.79 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  22.22 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  22.22 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  29.46 
 
 
148 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  22.05 
 
 
140 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  24.62 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  28.28 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  22.22 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  23.19 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  22.05 
 
 
140 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  22.76 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  24.62 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  22.63 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  22.39 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  21.37 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>