56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0812 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  49.32 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  49.32 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  49.32 
 
 		 148 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  49.32 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  49.3 
 
 		 145 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  48.63 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  48.63 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  48.63 
 
 		 148 aa  154  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  47.95 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  50.67 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  48.53 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  46.81 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  46.43 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  49.64 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  48.18 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  41.73 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  43.48 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  43.48 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  46.72 
 
 		 142 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  46.15 
 
 		 140 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  43.07 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  44.62 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  44.88 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  37.14 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  44.96 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  39.42 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  41.01 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  38.69 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  39.42 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  38.28 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  32.84 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  28.37 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  34.33 
 
 		 144 aa  84.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  30.28 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  30.34 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  27.86 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  28.68 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  27.74 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  27.91 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  25.78 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  27.7 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  25.87 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  24.64 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  24.64 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  25.22 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  23.81 
 
 		 143 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1979  hypothetical protein  30.23 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  23.24 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>