56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3372 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  57.45 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  54.61 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  48.55 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  46.43 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  42.86 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  48.18 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  42.86 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  42.14 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  42.14 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  42.86 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  43.57 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  47.76 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  45.99 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  46.56 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  38.46 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  42.64 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  43.48 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  37.14 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  39.71 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  40.71 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  41.3 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  41.3 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  38.85 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  35.25 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  37.68 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  37.68 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  31.5 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  36.88 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  33.81 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  26.62 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  26.52 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  26.56 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  27.61 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  31.29 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  26.92 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  23.7 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  25.58 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  29.08 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  27.66 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  28.99 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  31.58 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  23.13 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  27.54 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  30.09 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  25.58 
 
 		 119 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>