47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1179 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  63.38 
 
 
144 aa  202  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  36.09 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  37.68 
 
 
159 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  34.25 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  38.35 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  34.53 
 
 
141 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  37.32 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  37.86 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  34.31 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  33.58 
 
 
147 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  32.61 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  40.46 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  38.93 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  40.46 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  31.5 
 
 
143 aa  94  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  32.85 
 
 
148 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  32.85 
 
 
148 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  33.33 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  32.14 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  32.33 
 
 
139 aa  93.2  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  29.1 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  36.92 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  32.14 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  32.14 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  32.14 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 
139 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  32.84 
 
 
167 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  30.94 
 
 
148 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  33.09 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  34.62 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  30.23 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  30.83 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  31.62 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  26.28 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  30.3 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  30.3 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  27.61 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  31.85 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  27.61 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  26.87 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  33.08 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  24.81 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>