62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1330 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  44.27 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  39.42 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  46.56 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  37.41 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  40.88 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  40.88 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  41.04 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  36.09 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  42.75 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  38.69 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  41.22 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  38.46 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  38.85 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  37.23 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  37.31 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  37.96 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  38.69 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  40.15 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  41.98 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  41.73 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  38.35 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  38.17 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  37.96 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  39.55 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  37.41 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  35.82 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  37.96 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  36.57 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  36.57 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  38.28 
 
 		 167 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  31.39 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  27.41 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  31.34 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  28.99 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  23.57 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  26.87 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  27.41 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  26.36 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  27.14 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  25.18 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  25 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  26.81 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  23.53 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  25.37 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  26.32 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  23.78 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  22.79 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  24.63 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  26.17 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  25.23 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  20.16 
 
 		 157 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  20.16 
 
 		 157 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  20.16 
 
 		 157 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>