58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3035 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  349  8e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  65.47 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  64.03 
 
 		 148 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  66.19 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  63.31 
 
 		 148 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  64.03 
 
 		 148 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  63.31 
 
 		 148 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  63.31 
 
 		 148 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  60.56 
 
 		 148 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  61.87 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  50.67 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  44 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  44.93 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  44.2 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  45.11 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  44.36 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  46.27 
 
 		 140 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  45.93 
 
 		 147 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  49.24 
 
 		 139 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  47.76 
 
 		 143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  47.79 
 
 		 139 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  47.69 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  41.96 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  39.42 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  39.42 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  39.42 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  40.14 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  41.73 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  37.04 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  34.07 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  34.72 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  33.57 
 
 		 144 aa  90.9  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  30.83 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  31.33 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  28.37 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  26.62 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  27.61 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  27.78 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  27.59 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  26.47 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  30.51 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  25.17 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  25.89 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  24.24 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  24.24 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  24.24 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  28.21 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  24.09 
 
 		 157 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  24.79 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>