55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2100 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  289  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  77.86 
 
 		 140 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  70 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  70 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  61.43 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  58.57 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  57.86 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  59.29 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  44.29 
 
 		 148 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  45.71 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  45.71 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  40.29 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  43.57 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  43.57 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  40.29 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  42.14 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  42.14 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  44.29 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  43.88 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  37.31 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  38.69 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  41.3 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  37.04 
 
 		 167 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  36.96 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  40.58 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  33.56 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  34.56 
 
 		 143 aa  100  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  36.5 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  40.48 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  37.32 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  34.03 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  35.21 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  32.87 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  32.58 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  32.81 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  35.11 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  28.12 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  31.93 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  25.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  26.12 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  25.93 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  26.32 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  24.58 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  24.58 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  22.05 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  24.79 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  23.73 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  23.93 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  26.13 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>