63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0469 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  61.87 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  62.12 
 
 		 159 aa  163  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  55.07 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  56 
 
 		 162 aa  159  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  54 
 
 		 162 aa  153  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  51.09 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  46.32 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  43.15 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  42.75 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  35.88 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  38.16 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  32.59 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  35.25 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  26.85 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  27.52 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  26.17 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  29.2 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  28.87 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  30.28 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  28.37 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  27.52 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  30.66 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  30.66 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  29.93 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  29.93 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  35.61 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  35.82 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  35.82 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  32.03 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  28.37 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  26.62 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  28.99 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  36.3 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  32.06 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  30.66 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  32.37 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  32.58 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  27.01 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  29.77 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  30.6 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  29.46 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  27.61 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  27.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  22.12 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  18.62 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  24.49 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1222  hypothetical protein  27.55 
 
 		 125 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  24.76 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  28.81 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  22.86 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  26.67 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  26.71 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  25.22 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  26.45 
 
 		 143 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  21.21 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4269  hypothetical protein  22.58 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.237355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1258  hypothetical protein  22.45 
 
 		 137 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>