23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1258 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1258  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4269  hypothetical protein  49.17 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.237355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1222  hypothetical protein  53.6 
 
 
125 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  47.54 
 
 
125 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  49.17 
 
 
130 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  42.28 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  43.09 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2085  hypothetical protein  45.08 
 
 
129 aa  123  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00513635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1403  hypothetical protein  32.03 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0531  hypothetical protein  30.53 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4834  hypothetical protein  30.71 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_10591  predicted protein  31.31 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120478  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4691  hypothetical protein  29.23 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220127  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49656  predicted protein  26.47 
 
 
399 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309902  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  29.66 
 
 
363 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  25 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  24.32 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  25.51 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31684  predicted protein  25.22 
 
 
231 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  26.92 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  24.47 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  22.45 
 
 
149 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>