58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1166 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  98.65 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  98.65 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  90.54 
 
 		 148 aa  284  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  79.05 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  79.73 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  77.7 
 
 		 148 aa  247  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  79.73 
 
 		 148 aa  245  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  75.69 
 
 		 145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  63.31 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  52.52 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  48.63 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  50.38 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  46.76 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  46.97 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  43.57 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  44.29 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  47.33 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  42.54 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  43.18 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  48.48 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  47.73 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  40.29 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  40.29 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  42.34 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  37.14 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  38.03 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  37.41 
 
 		 159 aa  105  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  34.29 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  34.01 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  33.58 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  29.93 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  29.85 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  27.08 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  30.34 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  27.54 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  27.59 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  27.59 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  28.15 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  27.07 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  27.91 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  33.63 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  28.89 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  29.2 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  29.2 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  23.7 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  28.7 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  28.7 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  23.77 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  23.77 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  23.77 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  22.95 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>