56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3015 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  70.71 
 
 		 140 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  70 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  60 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  43.48 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  45.26 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  40.6 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  38.85 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  39.57 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  41.35 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  41.35 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  40.29 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  39.42 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  40.29 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  40.29 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  33.81 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  40.58 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  39.57 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  36.57 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  36.5 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  37.68 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  38.24 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  36.43 
 
 		 144 aa  95.9  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  32.88 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  40.46 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  34.04 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  35.82 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  30.23 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  31.47 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  33.08 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  29.03 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  27.34 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  30.95 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  26.36 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  28.03 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  26.76 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  25.42 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  24.27 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  24.58 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  25.81 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  25 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>