59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2096 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  330  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  44.27 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  41.3 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 141 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  42.64 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  38.41 
 
 		 144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  42.64 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  40.62 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  43.48 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  39.84 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  40.16 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  39.06 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  39.06 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  38.76 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  37.41 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  37.41 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  36.69 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  37.41 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  39.42 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  38.13 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  38.13 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  40.44 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  34.69 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  39.53 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  40.48 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  34.07 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  34.56 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  32.35 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  31.06 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  31.06 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  31.16 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  30.37 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  29.55 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  25.93 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  27.14 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  29.01 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  26.49 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  26.89 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  26.89 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  27.87 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  26.77 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  27.36 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  24.62 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  24.37 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  26.42 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  25 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  22.03 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>