30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5328 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  68.39 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  68.55 
 
 		 163 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  67.1 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  67.1 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  67.1 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  67.1 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  68.83 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  65.77 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  62.91 
 
 		 174 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  62.67 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  60.78 
 
 		 158 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  60.78 
 
 		 158 aa  200  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  58.82 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  59.48 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  64.86 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  64.43 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  50.99 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  52.38 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  39.86 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  50.32 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  42.77 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  47.06 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  30.22 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  26.61 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  26.24 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  23.84 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  22.95 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  23.77 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>