29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3555 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  71.34 
 
 		 163 aa  222  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  69.93 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  67.74 
 
 		 174 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  68.83 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  67.32 
 
 		 157 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  66.67 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  64.05 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  65.38 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  65.38 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  65.38 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  63.4 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  66.44 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  62.75 
 
 		 158 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  65.38 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  67.1 
 
 		 163 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  65.1 
 
 		 160 aa  183  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  50.33 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  53.5 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  44.94 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  44.94 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  40.79 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  44.67 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  45.91 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  29.92 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  27.61 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  28.99 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  32.12 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>