29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl176 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  302  9.000000000000001e-82  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  32.64 
 
 
156 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  34.03 
 
 
158 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  30.22 
 
 
157 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  34.65 
 
 
159 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  33.86 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  36.24 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  38.89 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  32.28 
 
 
157 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  32.28 
 
 
157 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  32.28 
 
 
157 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  31.54 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  30.95 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  30.56 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  34.75 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  29.92 
 
 
156 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  31.17 
 
 
171 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  30.71 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  31.09 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  28.86 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  27.7 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  30 
 
 
174 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  22.3 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  25.22 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  17.78 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  24.14 
 
 
148 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>