27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1261 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  92.64 
 
 		 163 aa  297  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  80 
 
 		 157 aa  266  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  72.26 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  70.97 
 
 		 158 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  72.08 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  69.68 
 
 		 158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  67.11 
 
 		 163 aa  221  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  67.74 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  64.9 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  61.04 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  61.04 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  61.04 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  62.91 
 
 		 157 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  63.51 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  58.97 
 
 		 157 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  64.14 
 
 		 160 aa  178  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  54.25 
 
 		 156 aa  171  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  53.16 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  42.48 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  47.71 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  49.03 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  48.73 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  25.19 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  27.56 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>