26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1448 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  338  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  59.49 
 
 		 165 aa  210  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  56.25 
 
 		 171 aa  198  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  55.7 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  47.68 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  44.94 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  46.1 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  46.58 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  45.45 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  45.06 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  44.52 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  43.59 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  44.52 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  45.89 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  42.5 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  42.5 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  42.5 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  49.01 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  42.77 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  42.21 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  45.4 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  44.44 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  32.7 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  27.7 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3037  hypothetical protein  29.27 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>