9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3037 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3037  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0690  hypothetical protein  70.37 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0421  protein of unknown function DUF1486  68.1 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.378501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  63.8 
 
 		 170 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1614  hypothetical protein  30.43 
 
 		 99 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  31.97 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  31.15 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  29.92 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>